原文：doi:10./science.abo.
大豆“症青”病害研究方面获进展
-08-01报道，近日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心研究员王二涛团队以Wholeplantmicrobiomeprofilingrevealsanovelgeminivirusassociatedwithsoybeanstay-greendisease为题在PlantBiotechnologyJournal上在线发表研究，利用多组学高通量测序解析了大豆“症青”发生相关的细菌、真菌和病毒微生物组，发现“症青”的发生与一种新型双生病毒的侵染紧密相关，同时发现“症青”发生伴随着大豆籽粒微生物组丰度的升高和细菌菌群稳态的失衡。
该研究通过多组学联动将微生物菌群失调和双生病毒侵染与大豆“症青”发生建立关联，为农作物病原的快速鉴定提供了范例，为大豆“症青”的防治提供了重要的理论基础。
CurrDevelNutrit：绿茶提取物或能促进肠道健康并帮助降低血糖水平
-07-29报道，近日，一篇发表在国际杂志CurrentDevelopmentsinNutrition上题为“Catechin-RichGreenTeaExtractReducedIntestinalInflammationandFastingGlucoseinMetabolicSyndromeandHealthyAdults:ARandomized,Controlled,CrossoverTrial”的研究报告中，来自宾夕法尼亚州立大学等机构的科学家们通过研究对携带一组心脏病风险因子的人群进行研究后发现，摄入绿茶提取物四周时间或能通过降低机体自身的炎症及“肠漏”，从而降低机体的血糖水平并改善机体肠道健康。
研究者Bruno指出，肠道衍生产物的吸收被认为是诱发肥胖和胰岛素抵抗的起始因素，而这或许就是人类心脏代谢疾病的核心，如果能够改善肠道的完整性并降低肠道渗漏，研究人员或许不仅能够减缓低级别炎症所引起的心脏代谢疾病，还能潜在地逆转这些疾病。目前研究人员并没有试图在一个月的时间里来治愈患者的代谢综合征，但基于他们对代谢性综合征背后因果因素的理解，绿茶有可能至少部分会在肠道层面上发挥作用，从而就能减缓发展为代谢综合征的风险。目前研究人员正在分析研究中参与者肠道中的微生物群落以及其血液中细菌相关毒素的水平。
山茶科木荷属超级条形码研究获进展
-07-29报道，近日，中国科学院昆明植物研究所东亚特征植物分类与系统演化专题攻关组与国内外学者合作，对采自中国、尼泊尔和缅甸的12种58份木荷属植物样品进行基因组浅层测序，获得了rbcL+matK+trnH-psbA叶绿体片段和ITS序列的传统DNA条形码数据以及叶绿体全基因组和核糖体DNA序列的超级DNA条形码数据。基于以上数据，研究利用距离法和建树法，对比分析了传统条形码与超级条形码在木荷属植物的鉴定效率。研究显示，基于rbcL+matK+trnH-psbA叶绿体片段、ITS序列和核糖体DNA全长序列在木荷属中物种鉴定率为0%。叶绿体全基因组仅鉴定出3个物种（小花木荷、钝齿木荷和贡山木荷独龙变种），为目前已知的超级条形码最低的鉴定成功率（27.27%）。复杂的演化历史如近期分化导致的遗传分化程度低、自然杂交或基因渐渗、不完全谱系分选等，或影响木荷属DNA条形码有效性；基于形态学特征的植物经典分类可能高估了木荷属的多样性，造成一定程度的过度物种划分。研究表明，超级条形码并不能幸免于由类群本身复杂的进化历史带来的挑战。科研人员呼吁基于新一代测序技术开发更多核基因条形码片段，用于木荷属及其他类似植物类群的物种鉴定及识别。
相关研究成果以SpeciesdiscriminationinSchima(Theaceae):Next-generationsuper-barcodesmeetevolutionary
研究发现，与已知的寄生植物菟丝子演化过程不同，列当科的寄生植物随着寄生习性的加深，基因组大小和基因数量没有发生剧烈的收缩；相反，与自养的钟萼草相比，半寄生和全寄生的列当科植物基因组都更大，基因数量更多。
科学家揭示六倍体栽培燕麦的起源与演化
年7月18日，NatureGenetics在线发表了题为Referencegenomeassembliesrevealtheoriginandevolutionofallohexaploidoat的研究论文。该研究发布了栽培六倍体裸燕麦及其二倍体和四倍体祖先的高质量参考基因组，并探索了六倍体燕麦的起源与亚基因组演化。该研究由四川农业大学、吉林省白城市农业科学院、中国科学院遗传与发育生物学研究所以及四川大学等高校和科研院所合作完成。
Nature：普林斯顿大学研究揭示招蜂引蝶的害处
年7月20日，普林斯顿大学的研究人员在Nature期刊发表了题为：Competitionforpollinatorsdestabilizesplantcoexistence的研究论文。该研究指出，对传粉昆虫的争夺可能会降低植物物种的共存能力。这种效应也许会影响植物的多样性，被认为会随传粉生物数量的减少而扩大。
作者总结称，研究结果揭示了不同植物种间相互作用会如何减弱，以及植物争夺传粉生物注意力会如何加重种间竞争失衡。他们指出，这些信息对于确定传粉生物减少的生态学影响具有重要意义。
半干旱区深层土壤微生物变化研究方面获进展
-07-22报道，近日，中国科学院院士、中科院水土保持研究所研究员邵明安团队研究员魏孝荣等，以我国典型生态恢复区——黄土高原为对象开展研究，在退耕与深层土壤微生物群落和功能性变化及驱动因子方面取得进展。研究发现，造林对深层（-cm）土壤微生物群落和功能的影响显著大于浅层土壤（0-cm），这种影响主要表现在降低了细菌beta多样性、网络稳健性和功能，且这种影响与造林后深层土壤干化密切相关。结果表明，干旱半干旱地区恢复生态系统的退化或是深层土壤水分的过度消耗及其导致的微生物群落变化和功能损失共同损失造成，为土地利用变化和微生物之间的关系提供了新认识。研究提出，在评估干旱半干旱地区造林的生态环境效应和可持续性时，应充分考虑深层土壤微生物的负面响应。
相关研究成果研究以Afforestationcanlowermicrobialdiversityandfunctionalityindeepsoillayersinasemiaridregion为题，在线发表在GlobalChangeBiology上。研究工作得到中科院战略性先导科技专项、国家自然科学基金和中科院前沿科学重点研究计划的支持。
核基因和形态学证据揭示我国梨藤竹属的分类学谜团
-07-22报道，中国科学院昆明植物研究所研究员李德铢攻关团队长期致力于竹亚科的分类学、分子系统发育和生物地理学研究。科研团队前期利用改良的简化基因组测序（MiddRAD-seq）得到的单核苷酸多态性（singlenucleotidepolymorphisms，SNPs）数据，探讨了旧世界热带木本竹分支中箣竹-牡竹-巨竹复合属群（BDG
相关研究成果以TheidentityofDinochloaspeciesandenumerationofMelocalamus(Poaceae:Bambusoideae)inChina为题，发表在PlantDiversity上。研究工作得到国家自然科学基金、云南省博士后定向培养资助项目及云南省重点研发计划项目的支持。
NaturePlants:发现小麦增产的新基因
-07-21报道，7月7日，中国科学院遗传与发育生物学研究所焦雨铃研究组在NaturePlants上，发表了题为ImprovingbreadwheatyieldthroughmodulatinganunselectedAP2/ERFgene的研究论文，报道了一个全新的提升小穗数的新基因DUO-B1。NaturePlants同期刊发了介绍该成果的研究简报（Gainingrainyieldinwheatwithextraspikelets）。
该研究在二穗短柄草中发现了一个穗多分枝的突变体，并分离到对应的基因BdDUO1。该基因编码一个ERF类转录因子。该基因的拟南芥同源基因突变后，茎生叶分枝数有微弱提升。而该基因在普通小麦B基因组中的同源基因DUO-B1表达在群体中与穗粒数负相关，提示参与穗发育调控。对DUO-B1敲除后，研究发现突变体具有多小穗的表型，且其他农艺性状无明显改变。突变体中穗中部在一个穗节处形成多个小穗，从而提升了穗粒数。
该突变体的多年多条件种植结果显示，在中等密度的田间种植条件下duo-B1突变体穗粒数提升并可增产~10%。在密植条件下虽穗粒数提升，但被千粒重的降低所抵消，突变体无明显产量提升。进一步研究发现，突变体中穗原基中细胞分裂增加，并发现DUO-B1作为转录因子激活了已知穗分枝抑制基因WFZP的表达。分析发现，DUO-B1位点无明显的选择信号，说明是尚未被充分利用的新位点。
该研究发现了一个能够通过增加小穗数提升产量的新基因，对于剖析小麦产量性状形成的机制具有重要意义，并为小麦高产育种提供了重要的基因资源。研究工作得到国家自然科学基金、中科院战略性先导科技专项和植物基因组学国家重点实验室的支持。中国农业科学院作物科学研究所、河北师范大学与中科院植物研究所的科研人员亦对本研究中做出了重要贡献。
樱桃果实“双胞胎”形成机理上取得重要进展
-07-20报道，近日，上海交通大学核果类栽培与育种研究室张才喜团队在EnvironmentalandExperimentalBotany上发表了题为“FRUITFULLisinvolvedindoublefruitformationathightemperatureinsweetcherry”的研究论文。该研究分析了未来的气候变化及不同气候条件下的“双子果”的发生率，探讨PavFUL基因与“双子果”形成的机理。本研究为探索果树“双子果”形成的分子机制以及选育适合高温栽培条件的品种奠定了理论基础。
石菖蒲及单子叶植物祖先基因组演化研究中获进展
-07-18报道，《自然-植物》（NaturePlants）在线发表了中国科学院武汉植物园王青锋/陈进明团队与法国国家农业食品与环境研究院合作完成的研究成果（Theslow-evolvingAcorustatarinowiigenomeshedslightonancestralmonocotevolution），公布了单子叶植物最早期分支菖蒲目中的重要水生药用植物石菖蒲（Acorustatarinowii）的基因组。该研究初步揭示了单子叶植物祖先早期基因组演化过程和规律，为剖析包括禾本科在内的单子叶植物辐射进化过程奠定了重要基础。
科研人员创制简便高效玉米单倍体诱导系MAGIC
-07-18报道，近日，中国农业科学院生物技术研究所作物功能基因组研究中心与国内高校合作，创制出不受材料背景影响、简便高效、单倍体鉴别准确率达99.1%的玉米诱导系MAGIC1和升级版MAGIC2，进一步提升了单倍体育种技术应用效率。相关成果发表在《植物杂志（ThePlantJournal）》。
该研究两个版本的单倍体诱导系实现了单倍体幼胚的直接鉴别，可显著提高单倍体幼胚鉴别与加倍技术应用效率，在单倍体育种中具有较大的应用潜力。相关技术已经获得国家发明专利授权。
产纤维素酶菌株诱变育种及产酶机理研究中获进展
-07-14报道，近日，中国科学院近代物理研究所生物物理室科研人员在长枝木霉重离子诱变选育及产酶机理研究方面取得进展。相关成果发表在BiotechnologyforBiofuelsandBioproducts上。
研究人员利用重离子诱变技术对非模式工业产酶菌株——长枝木霉进行辐照诱变，并选育获得优良突变菌株LC-M4和LC-M16，其滤纸酶活分别达到了4.51IU/mL和4.16IU/mL，较野生菌株分别提高了46.91%和35.5%。借助转录组学和蛋白质组学技术，研究人员进行了长枝木霉突变菌株与野生菌株的高产酶及分泌调控机理解析，发现突变菌株中与酶蛋白加工修饰和分泌相关途径的显著改变是纤维素酶高产的主要原因。通过联合分析，研究人员筛选获得了影响长枝木霉纤维素酶合成分泌的五个关键候选基因，为产酶菌株的定向基因工程设计和改造提供了参考靶点。此外，科研人员还利用研究中获得的差异表达基因、差异表达蛋白和关键候选基因构建了丝状真菌纤维素酶蛋白分泌途径模型，补充和完善了丝状真菌纤维素酶代谢调控过程及蛋白合成分泌途径。
Nature：首次发现马钱子植物中的番木鳖碱生物合成途径
-07-14报道，在一项新的研究中，来自德国马克斯-普朗克化学生态研究所的研究人员揭示了植物马钱子（Strychnosnux-vomica）中形成番木鳖碱（strychnine，也译为士的宁，马钱子碱）的完整生物合成途径。他们确定了参与番木鳖碱和其他代谢物的生物合成的所有基因，并在模式植物本氏烟草（Nicotianabenthamiana）中表达了这些基因。这使他们能够证实这些极其复杂和具有药理学意义的分子可以用“代谢工程（metabolicengineering）”方法合成。相关研究结果于年7月6日在线发表在Nature期刊上，论文标题为“Biosynthesisofstrychnine”。
doi:10./s---4.
TheoreticalandAppliedGenetics:揭示低温下黄瓜种子萌发的调控机制
-07-12报道，近日，中国农业科学院蔬菜花卉研究所葫芦科蔬菜遗传育种创新团队在低温胁迫黄瓜种子萌发研究方面取得重要进展。该研究图位克隆了调控低温下黄瓜种子萌发的基因CsGAI,并初步探究了该基因调控低温下种子萌发的网络途径。相关研究结果以“TheqLTG1.1candidategeneCsGAIregulateslowtemperatureseedgerminationincucumber”为题发表于国际著名植物学期刊TheoreticalandAppliedGenetics上。
该论文以中国农业科学院蔬菜花卉研究所为第一和通讯作者单位，李彩霞博士研究生为第一作者，董邵云博士为共同一作，顾兴芳研究员和张圣平研究员为共同通讯作者。该研究受到国家自然科学基金、现代农业产业技术体系、中国农业科学院创新工程等项目资助。
FrontiersinPlantSciences:发现调控红豆草缩合单宁生物合成关键基因
-07-12报道，近日，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所牧草种质资源保护与利用科技创新团队研究通过种质资源评价发现调控红豆草缩合单宁生物合成的关键基因，为牧草缩合单宁的品质改良提供了重要参考。相关研究成果发表在《植物科学前沿（FrontiersinPlantSciences）》上。
JournalofIntegrativePlantBiology:发现油菜素甾醇信号调控水稻亚种间多性状分化
-07-12报道，近日，中国农业科学院作物科学研究所水稻分子设计技术与应用创新团队通过研究发现，整体上籼稻对油菜素甾醇（BR）的敏感性显著强于粳稻，BR信号组分OsBSK2的自然变异影响了其自抑制活性和蛋白稳定性，从而介导了BR敏感性以及多个性状的籼粳分化。本研究首次揭示了植物激素途径参与多个性状的籼粳分化，为水稻多性状聚合遗传改良提供了新的理论基础。相关研究成果在线发表于《植物学报（JournalofIntegrativePlantBiology）》上。
研究揭示淬灭抑制蛋白SOQ1调节qH的作用机制
-07-11报道，NaturePlants发表了中国科学院生物物理研究所研究员李梅课题组与瑞典于默奥大学副教授AlizeeMalnoe课题组合作完成的题为StructureofArabidopsisSOQ1lumenalregionunveilsC-terminaldomainessentialfornegativeregulationofphotoprotectiveqH的研究论文。
该研究对拟南芥来源的SOQ1开展了结构与功能研究，解析了SOQ1腔侧结构域（SOQ1-LD）不同截短体和突变体的四个晶体结构及SOQ1-LD低分辨率的电镜结构。研究发现，除了此前研究发现的3个结构域外，SOQ1的C端个氨基酸形成一个独立的结构域CTD，并在qH的抑制中发挥重要作用。结合结构分析比较及相关的功能实验和体内数据，研究提出了SOQ1负调控LCNP发挥作用的模型（如图），从结构的角度对SOQ1抑制LCNP的机理进行探讨，为剖析NPQ（qH）的调控机制奠定了坚实的结构基础。
研究工作得到国家重点研发计划、中科院战略性先导科技专项（B类）、国家自然科学基金和中科院青年创新促进会等的支持。数据收集和样品分析等工作得到生物物理所生物成像中心、生物物理所蛋白质科学研究平台、上海同步辐射光源等的协助。其中，电镜样品的制备使用了孙飞课题组研发的冷冻电镜支持膜HFBI-film，在一定程度上解决了取向优势的问题。
金橘属分类学研究获进展
-07-11报道，为探究金橘属的系统地位，厘清该属属下分类关系，中国科学院武汉植物园东非植物区系与分类学科组联合湖南师范大学生命科学学院植物分类学团队、湖南省生态环境农村工作站，针对金橘属植物在国内开展了大量野外调查，获得了该属植物第一手详实准确的形态学资料，并利用扫描电镜进行了孢粉特征观察，获取了金橘属孢粉微形态学数据。研究人员在全国范围内广泛采样，利用叶绿体基因组和ITS片段构建了该属的系统发育关系，确认了金橘属的分类关键特征，对金橘属进行了分类修订，解决了传统金橘属的系统地位及属下分类问题。
研究结果表明，根据形态学、孢粉学及分子生物学证据，金橘属与柑橘属亲缘关系近，且在形态学、孢粉学和分子生物学特征等方面有重合。该研究支持将金橘属并入柑橘属；金橘属中的金豆、山橘和金柑在形态和孢粉学特征，特别是分子序列特征等方面区别明显，三者应分别视为独立的种。马来亚金柑、金橘、霸王金橘及多个杂交种等与金柑无本质区别，分别作为后者的异名处理。
研究将金豆、山橘作为独立的种移至柑橘属中，并提出这两个种的新组合名称，它们的种名仍沿用以前的种加词：（1）金豆Citrusvenosa(Champ.exBenth.)K.M.Liu,X.Z.CaiG.W.Hu,